Du nesusiję tyrimai atskleidė CRISPR-Cas12a inhibitorius

How to make stress your friend | Kelly McGonigal (Birželis 2019).

Anonim

Du komandos, nepriklausomai vienas nuo kitos, nustatė keletą CRISPR-Cas12a inhibitorių. Pirmąją komandą sudarė nariai iš Kalifornijos universiteto Berkeley, kiti turėjo Masačiusetso ligoninės ir Kalifornijos universiteto narių. Abiejuose naudojami bioinformatikos įrankiai skenuoti bakterijų genomus galimų inhibitorių atveju, ir abu paskelbė savo rezultatus žurnale " Science".

CRISPR yra genų redagavimo technologija, kuri gali atpažinti DNR segmentus ir išnaikinti jas iš genomo. Jis taip pat gali būti naudojamas norint pakeisti segmentus, kurie buvo iškirpti. Norėdamas atlikti savo pareigas, CRISPR naudoja baltymų nukleazę, kuri yra orientyras ar šablonas, kuriame nurodomi, kurie genai turi būti supjaustyti ir (arba) pakeisti. "Cas9", dažnai naudojama tam tikslui daugelyje ankstyvųjų studijų, buvo susijęs su technika. Tačiau, kad "Cas9" tinkamai veiktų, mokslininkai taip pat turėjo įtraukti Cas9 inhibitorių - jo užduotis - išvengti pašalinio pjovimo. Neseniai mokslininkai naudojo "Cas12a", nes siūlo kitas pageidaujamas savybes, kurios nėra "Cas9". Tačiau iki šiol "Cas12a" inhibitoriai nebuvo žinomi, o tai trukdė naudoti tyrimus. Šių dviejų naujų pastangų metu abi komandos nustatė keletą inhibitorių, kurie, jų nuomone, yra tinkami naudoti su CRISPR.

Abiejose grupėse buvo naudojamas bioinformatikos vamzdynų metodas ieškant Cas12 inhibitorių - tai bakterijų genomų paieškų sistema, kurioje ieškoma genetinių fragmentų, kurie paprastai būna mirtini bakterijoms, tačiau nėra susiję su bakterijomis, turinčiomis inhibitorių. Naudodamasis tokiu metodu, pirmoji komanda nustatė tris inhibitorius, tarp kurių buvo ir "AcrVA1". Tyrimas su žmogaus ląstelėmis parodė, kad visi trys gali būti naudojami kartu su CRISPR. Naudodamas tą patį pagrindinį požiūrį, antroji komanda surastų keletą kandidatų, kurie taip pat dirbo, kaip tikėtasi, bandydami su žmogaus ląstelėmis. Antroji komanda taip pat nustatė, kad AcrVA1 yra ypač efektyvus.

Apskritai, dviejų grupių darbas atskleidė keletą galimų "Cas12a" inhibitorių, iš kurių vienas pasirodė ypač perspektyvus. Tai galėtų paskatinti daugiau vaisingų tyrimų, naudojant CRISPR-Cas12a kaip naują genų redagavimo įrankį.

menu
menu